发布日期:2024-07-03 17:58 点击次数:145
最近有好多小伙伴们思知谈奈何查找基因的5'UTR、3'UTR、内含子和外显子。尤其是在看了往期稿子:荧光素酶评释(luciferase reporter)在microRNA洽商中的讹诈
因为microRNA靶向的是基因的3'UTR,思作念这个履行的问题等于不知谈奈何找基因的3'UTR。
今天就带来保姆级的查找基因的5'UTR、3'UTR、内含子和外显子的时势教程,各人照着每步的箭头拓荒操作就行了。
(1)开放NCBI,将搜索本色遴荐为Gene,以东谈主源的IL-10基因为例,输出IL-10 human,点search。
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(2)搜索出来的第一条等于咱们需要的东谈主源的IL-10基因。点进去。
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(3)点进去之后是这么,浙江普莱得电器有限公司然后往下拉。
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(4)找到右上角的tools。
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(5)找到tools内部的“sequence text view”, 佛山市顺德区奥达信电器有限公司点进去就能看到基因的通盘序列信息了。
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(6)搜索效果奈何看?
蓝色象征的是5'UTR或3'UTR。红色象征的是外显子, 临沂世华手套辅料制品有限公司因为外显子要翻译成氨基酸,民族服装是以底下会给出对应的氨基酸序列。绿色象征的是内含子,内含子不翻译,是以底下莫得氨基酸序列。这里象征的神采是网站自动给出来的。若是页面上莫得披露馅来完好的5'UTR或3'UTR,不错点左上角的“Prev page”或“Next page”。
是以IL-10基因的3'UTR序列等于:
ACACATCAGGGGCTTGCTCTTGCAAAACCAAACCACAAGACAGACTTGCAAAAGAAGGC
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因为3'UTR在基因末尾,是以要把程度条往下拉,就能看到了。如下图蓝色象征部分。
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是以IL-10基因的5'UTR序列等于:
GACATCAGGGTGGCGACTCTATAGACTCTAGGACATAAATTAGAGGTCTCCAAAATCGGATCTGGGGCTCTGGGATAGCTGACCCAGCCCCTTGAGAAACCTTATTGTACCTCTCTTATAGAATATTTATTACCTCTGATACCTCAACCCCCATTTCTATTTATTTACTGAGCTTCTCTGTGAACGATTTAGAAAGAAGCCCAATATTATAATTTTTTTCAATATTTATTATTTTCACCTGTTTTTAAGCTGTTTCCATAGGGTGACACACTATGGTATTTGAGTGTTTTAAGATAAATTATAAGTTACATAAGGGAGGAAAAAAAATGTTCTTTGGGGAGCCAACAGAAGCTTCCATTCCAAGCCTGACCACGCTTTCTAGCTGTTGAGCTGTTTTCCCTGACCTCCCTCTAATTTATCTTGTCTCTGGGCTTGGGGCTTCCTAACTGCTACAAATACTCTTAGGAAGAGAAACCAGGGAGCCCCTTTGATGATTAATTCACCTTCCAGTGTCTCGGAGGGATTCCCCTAACCTCATTCCCCAACCACTTCATTCTTGAAAGCTGTGGCCAGCTTGTTATTTATAACAACCTAAATTTGGTTCTAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCCTAACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGATGGAAGTTGCAGTGAGCTGATATCATGCCCCTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAAAAATAAATTTGGTTCTAATAGAACTCAGTTTTAACTAGAATTTATTCAATTCCTCTGGGAATGTTACATTGTTTGTCTGTCTTCATAGCAGATTTTAATTTTGAATAAATAA ATGTATCTTATTCACATCA民族服装
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